醫保和工傷是兩個不同範疇，發生工傷事故，醫藥費應該先由企業墊付，然後再報銷。工傷事故用了醫保卡，所花費的所有醫療保險基金支付之外的費用可以由工傷保險報銷。
工傷事故的全部費用由單位支付，受傷員工可以在出院後到勞動局去做傷殘鑒定，根據鑒定報告的等級來得到相應的工傷補償。工傷認定程序如下：
壹、首先需要向當地勞動部門申請工傷認定，這是獲得賠償的前提。
二、填寫壹份工傷申請表，準備好身份證復印件和疾病證明書。
1、如果單位同意工傷就請法人在相關位置簽字，蓋單位公章。待社保工作人員調查後出工傷認定書。如認定為工傷，就可報銷相關治療費用。
2、另外壹種是單位不同意認定工傷，則由被申請單位提供不是工傷證據，社保機構會根據被申請單位提供證據認定是否是工傷。
3、還有壹種情況老板就是根本不認妳是他的工人，就要先請妳收集有雇傭關系的相關材料，再提起勞動仲裁，根據仲裁結果再到社保相關機構做工傷認定。
四、認定工傷後應當評殘疾等級和喪失勞動能力程度，這是計算賠償數額的依據。
五、如果加工廠仍不賠償，可以向當地勞動仲裁部門提起仲裁請求，由仲裁委員會依法裁決。裁決雙方當事人不服裁決的，可以向當地人民法院提起民事訴訟，進入兩審終審的訴訟程序。
六、計算賠償數額時都要依據《工傷保險條例》的規定，按照傷者上壹年度月平均工資和全省職工上年度平均工資計算數額。