1985年9月~1989年7月在遼寧師範大學生物系生物學專業學習獲學士學位；
1992年9月~ 1995年6月在遼寧師範大學生物系植物學專業學習獲碩士學位；
畢業論文：高粱根尖切除後再生過程的研究；研究方向植物形態發育；導師：徐愛菊教授。
1999年9月~2002年10月在中國科學院沈陽應用生態研究所生態學專業學習獲博士學位，畢業論文：中國裂葉苔科植物的研究——分類、區系和生態；導師：曹同研究員，研究方向苔蘚植物分類、區系和植物生態學。
2003年9月~2006年10月 沈陽農業大學植物保護學院博士後研究，合作導師：呂國忠，段玉璽教授 1. 2000年1月~2003年5月，參與國家重大自然科學基金項目《孢子植物誌》研編，本人撰寫“裂葉苔科和合葉苔科”部分。正在出版中。
2. 2002年9月，遼寧省教委B類項目，本人為主持人。（實際已經結題）0元
3. 2004年1月，國家自然基金項目：中國裂葉苔科植物的分類與分支系統修訂的研究；遼寧大學為合作單位，本人作為第壹參與人，目前該工作已經基本結束。5000元
主要科研論文：
1) Jun Sun & Tong Cao 2001. Lophozia diversiloba Hatt.(Hepaticae;Lophoziaceae) discovered in China. Arctoa( 俄羅斯)10:43-44.
2) Chi en Gao Tong Cao &Jun Sun. 2002.The genus Isotachis (Hepaticae; Ba1antiopsaceae) in China. The BryoIogist ( 美國),105(4):101-106.
3) Sun Jun,Cao Tong, Gao Q ian, 2002. Studies on the Genus Lindbergia (Musci, Leskeaceae)in China.遼寧大學學報,29(2):145-154.
4) Gao,C., Cao,T. & S. Jun. 2002. The genus Mnio1oma (Hepaticae, Ca1ypogeiaceae) new to China discovered from Taiwan. Arctoa11:1-3.
5) 孫軍,高謙,曹同,2002. 中國挺葉苔屬(Anastrophyllum(Hepaticae)) 壹新記錄種.植物研究,22(2):131-132.
6) 孫軍,曹同,高謙,2002. 中國疣葉苔屬 Horikawella(Hepaticae) 壹新記錄種.雲南植物研究,24(3): 311-312.
7) 孫軍，高謙，曹同，2003. 中國三瓣苔屬(Tritomaria (Hepaticae))壹新記錄變型. 植物研究 23 （2）：143-146.
8) 曹同, 沙偉, 孫軍,王艷君. 2002. 東北產 6 種苔類植物的細胞學觀察. 植物研究 22(4): 453-455.
9) 曹同,郭水良,孫軍. 2002年.《生物多樣性保護與區域可持續發展》, 第四屆全國生物多樣性保護與可持續利用研討會論文集,204-210。
10）孫軍，曹同，高謙，於晶. 2004. 中國四川合葉苔屬壹新種. 廣西植物 24(1): 23-24.
11）曹同，高謙，孫軍，於晶等. 2004. 中國西藏合葉苔屬（合葉苔科）壹新種?片毛合葉苔. 植物分類學報42 (2) : 180-182.
12）Sha,W.,Cao,T.,Sun,J.& J.W，Li.2002. Karyo1ogical studies of four species of Lophoziaceae(Hepaticae)from China.Wor1d Conference of Bryology,Lucknow, India 27-30 Jan.(Abstract). I. Cao T.,Sun,J.& C.Gao.2002.Leskeaceae pp.Wu, P.C.& R.M.Crosby (eds in chief), Moss Flora of China. English version,Vol.6 Hookeriaceae-Thuidiaceae. Science Press (Beijing,) & Botanica1 Garden Press (New York St.Louis).
II. 韓陽、孫軍、萬冬梅.《生態學基礎》(第二版), 2002年,遼寧大學出版社, 沈陽。