住院及特殊病種門診治療的結算流程：
1。定點醫療組織於每月10日前，將上月出院患者的花費結算單、住院結算單及有關資料報醫療保險經辦組織，醫療保險經辦組織審核後，作為每月預撥及年終決算的依據；
2。醫療保險經辦組織每月預撥上月的住院及特殊病種門診治療的統籌花費；
3。經認定患有特殊疾病的參保人員應到勞動保障部門指定的壹家定點醫療組織就醫購藥，發生的醫藥花費直接記帳，即時結算；
4。急診結算流程：參保人員因急診搶救到市內非定點的醫療組織及異處醫療組織住院治療，發生的醫療花費，先由個人或單位墊付，急診搶救終結後，憑醫院急診病歷、體檢、化驗報告單、發票、詳細的醫療收費清單等到醫療保險經辦組織按限定解決報銷手續。
1、跨省市外住院治療的，按照市內醫療機構類別起付線增加壹倍，報銷比例降低10%；2、省外醫院住院治療的，起付線按檔次住院總費用的20%計算(最低為兩千元，最高為壹萬)，報銷比例為55%。若是未經轉診到外地住院治療的，報銷比例再降低10%。註意：外省就醫時要提前辦理轉院、轉診證明，出院才能及時報銷。如果報銷不成功，就只能回到參保地進行報銷。普通門診報銷需提供：戶口本或身份證、參保票據；住院報銷需提供：戶口本或身份證、參保票據、住院發票、診斷證明、費用清單、住院病歷；大病統籌報銷需提供：戶口本、參保票據、住院發票、診斷證明、費用清單、住院病歷、合療首次報銷憑證。
希望以上內容能對您有所幫助，如果還有問題請咨詢專業律師。
法律依據：
《中華人民***和國社會保險法》第三十條
下列醫療費用不納入基本醫療保險基金支付範圍：
(壹)應當從工傷保險基金中支付的；
(二)應當由第三人負擔的；
(三)應當由公***衛生負擔的；
(四)在境外就醫的。
醫療費用依法應當由第三人負擔，第三人不支付或者無法確定第三人的，由基本醫療保險基金先行支付。基本醫療保險基金先行支付後，有權向第三人追償。