杜立新教授多年來從事動物遺傳資源保護、遺傳育種和生物技術的研究和教學工作。先後主持國家自然科學基金、“863”計劃、配套計劃等十余項重大科技重點項目，獲得國家級、省級科技進步獎6項，在國內外期刊和國際學術會議上發表論文150余篇，主編著作5部，培養博士、碩士研究生50余名。完善畜禽遺傳資源系統保存理論，構建最適合我國新興階段豬、牛、羊、禽遺傳資源保存的模式；發現並確定了小尾寒羊和灘羊多胎的主基因及其遺傳規律，以及中國綿羊的進化路徑；壹種快速檢測豬應激敏感基因的方法，可以通過壹個PCR反應同時檢測三個分子標記，即雌激素受體基因、促卵泡激素β亞基基因和控制體脂沈積的肥胖基因。對綿羊BMPR-IB、BMP15、GDF9、Y-box、TLRs和豬生長分化因子11mRNA等20個基因進行了克隆、測序和等位基因變異分析。確定了20多個影響奶牛乳房炎的基因，並建立了相關的分子診斷方法。開發了牛羊EST-SSR分子標記技術體系；制備了種系嵌合雞、雞胚胎幹細胞系、轉基因雞和體細胞核移植兔。目前，根據我國動物遺傳育種的發展需求和實際資源情況，正在主持“863”和科技支撐計劃，與北京、山東、河北、內蒙古、吉林、新疆、甘肅、寧夏等地的科研院所和育種企業開展綿羊品種改良、資源保護和分子育種技術研究。