清代中葉，“棲林集”是漢族商人與鄂溫克、鄂倫春獵民易物交換商品的集市，隸屬布特哈總管管轄。清末，1909年（清宣統元年）隸屬漠河總卡官管轄。中華民國成立後，始隸漠河設治局，後隸漠河縣管轄。1945年“九三”抗日戰爭勝利後，1947年3月，並人呼瑪縣，隸屬漠河區管轄，1950年改為第五區。60年代後期，為開發林區，設立了西林吉林業局。1973年3月，設置古蓮區。1981年8月，正式設置漠河縣，縣政府駐地西林吉，設置鎮的建制。
縣城西林吉鎮是1981年恢復建立漠河縣時，沿用開發大興安嶺原古蓮區時的西林吉鎮。西林吉原名叫作棲林集，也叫作齊林集，是額木爾河流域壹個氣候比較溫和的地方，是野生動物、鳥類比較集中的地方。準確位置在漠河稱作農業三連的地方。原古蓮區選址時，向南遷移了5千米，但仍屬棲林集小盆地。縣城初建時，中心保留壹片原始森林，辟為森林公園，取名為“松苑”。“松苑”占地6公頃。縣址西林吉鎮內街道路面由水泥或油渣鋪築，路面平坦。東面和南北主街寬16米，其他街道12米，寬窄壹致。
縣址西林吉鎮在1987年5月6日遭受特大森林火災洗劫後，縣城變為廢墟。大火撲滅後，由國務院復建指揮部和黑龍江復建指揮部在原來的縣址重新建設。鎮內占地由原來的5．74平方千米擴大為8．74平方千米。主要街道改建後，街道兩側修有下水道，排水通暢。整個縣城街面整潔，每條大街都有清潔工打掃，晴天無塵土飛揚，雨天無積水泥漿。南北主街道3條。
城鎮房屋建築，到1990年末統計，總建築面積311 985平方米，其中公用建築124 538．9平方米，居民住宅187 446．1平方米，科技教育、醫療衛生、文化娛樂、飲食服務、廣播電視、市內交通、通訊設施齊全。鎮內有工程師住宅樓兩棟，有中小學8所，醫院2所，建有環衛隊，保持了街道整潔、環境優美，已實現精神文明城鎮標準化。兒童娛樂中心由宋慶齡兒童基金會資助建成。大興安嶺“5·6”特大森林火災紀念館，位於城內17小區西北端，建築面積l 078．18平方米，有4個展廳，存有火災的圖片、實物、資料等，供人們參觀、反思。在26小區西側，建有大興安嶺最大的北陲封閉集市貿易市場。鎮內建有松苑、陽光、橋北3個社區。社區內多種健身器材、娛樂等各項公益活動設施齊全，均有2 000平方米以上室內、室外活動場所。