1985-2000年從事大熊貓野生種群生態學、社會行為、保護生物學和分子遺傳學研究。之後,她在中國西南山區和青藏高原開展了野生動物物種、生態學和保護生物學的研究,並將興趣延伸到生態與文化、社會、經濟和政策關系的跨學科研究。2000年,她對哈佛大學人口與發展研究中心進行了為期壹年的訪問,研究世界環境、可持續發展和人類健康之間的關系。2001在耶魯大學森林與環境學院擔任客座教授壹年,教授自然保護方面的研究生課程。
自1995以來,呂雉壹直參與自然保護的實踐示範,試圖在科學和實踐之間搭建壹座橋梁。她負責世界自然基金會(WWF)熊貓保護和西藏項目,並牽頭進行全面保護和開發。2002年,保護國際(CI)中國項目成立,該項目支持近50個基層非政府組織,並與它們討論中國資源和環境危機的本土化解決方案。
2007年,她和同事們壹起建立了山水自然保護中心,專註於展示人與自然和諧共處的最佳實踐,以行動為導向的研究以及在中國西部農村地區傳播保護理念。2008年,她創辦了北京大學自然保護與社會發展研究中心,專註於環境政策研究和領導力培訓。