壹、資金主要來源渠道不同
1、非銀行金融機構：非銀行金融機構 （non-bank financial intermediaries）以發行股票和債券、接受信用委托、提供保險等形式籌集資金，並將所籌資金運用於長期性投資的金融機構。
2、商業銀行：商業銀行是通過存款、貸款、匯兌、儲蓄等業務，承擔信用中介的金融機構。
二、資金運用的主要形式不同?
1、非銀行金融機構：非銀行金融機構吸引無數債權人債務人從事大規模借貸活動 ，可以用優惠貸款條件的形式分到債務人身上，可以用利息支付和其他利息形式分到債權人身上，也可以用優厚紅利的形式分到股東身上以吸引更多的資本。
2、商業銀行：商業銀行除了作為信用中介，融通貨幣資本以外，還執行著貨幣經營業的職能。通過存款在帳戶上的轉移，代理客戶支付，在存款的基礎上，為客戶兌付現款等，成為工商企業、團體和個人的貨幣保管者、出納者和支付代理人。
三、經營方式不同?
1、非銀行金融機構：非銀行金融機構經營方式有公募基金、私募基金、信托、證券、保險、融資租賃等機構以及財務公司等。非存款性金融機構包括金融控股公司，公募基金，養老基金，保險公司，證券公司。
2、商業銀行：中國商業銀行可以經營下列業務：吸收公眾存款，發放貸款；辦理國內外結算、票據貼現、發行金融債券；代理發行、兌付、承銷政府債券，買賣政府債券；從事同業拆借；買賣、代理買賣外匯；提供信用證服務及擔保；代理收付款及代理保險業務等。
按照規定，商業銀行不得從事政府債券以外的證券業務和非銀行金融業務。
參考資料鏈接：百度百科-商業銀行
參考資料鏈接：百度百科-非銀行金融機構