在國內外重要學術刊物上發表論文30余篇，其中Sci收錄4篇。撰寫了21世紀教材《食品化學》，任副主編。
(壹) 主要承擔的科研項目
1.主持國家自然科學基金項目“靈芝生物活性肽鏈形態結構與抗氧化保肝作用機制研究” （25萬）
2.主持國家863計劃項目“玉米蛋白酶法改性制備和在線分離系列活性肽集成技術研究” （50萬）
3.主持湖北省自然科學基金項目“玉米大豆蛋白的改性、生物活性及其構效關系研究” （3萬）
(二) 近年來發表論文及著作
著作
1. 闞建全，何慧（任副主編）等編，面向21世紀課程教材《食品化學》，中國農業大學出版社，2002，9
2. 闞建全，何慧等編，《食品化學》，臺灣新文京開發出版有限公司，2006.3
論文（註：*表示通訊作者）
1. JIE SUN, HUI HE* (correspondence author) et al. Novel Antioxidant Peptides from Fermented Mushroom Ganoderma lucidum. Journal of Agricultural and Food Chemistry. 2004.52.6646-6652. (SCI收錄期刊, IF: 2.327)
2. Yanling Shi, Jie Sun, Hui He*, Hui Guo, Sheng Zhang. Hepatoprotective effects of Ganoderma lucidum peptides against D-galactosamine-induced
liver injury in mice. Journal of Ethnopharmacology, (SCI刊源, online 23 February 2008)
3. HUI HE, JU-PING HE, et a1.The hepatoprotective effects of Ganoderma lucidum peptides against carbon tetrachloride-induced liver injury in mice. Journal of Food
Biochemistry. (SCI刊源 to be accepted)
4. 何慧等. 水溶性靈芝肽在動物體外的抗氧化活性，中國農業科學，2006，39（12）：2603-2607
5. 何慧等. 用玉米大豆復配蛋白制備降血壓肽水解酶篩選研究.中國糧油學報，2005.20（6）：25-29
6. 隋玉傑、何慧*等. 中性蛋白酶及堿性蛋白酶制備玉米蛋白水解物的醒酒活性比較. 中國糧油學報，2006.21（3）：102-106
7. 王進，何慧*等. 玉米肽、大豆肽及其復配肽的降血壓活性比較. 中國糧油學報，2007.22 (1)：45-47，72
8. 隋玉傑、何慧*等. 玉米醒酒肽的脫苦及其對活性的影響.中國糧油學報2007.22 (5)：44-48.
9.王進，何慧*等. 玉米大豆ACE抑制肽及其功能性質研究. 中國糧油學報2007.22 (6)：38-42
10. 何慧等. 靈芝肽在卵磷脂體系中的抗氧化作用研究. 農業工程學報，2004.20 (Supplement)：163-166
11. 何慧等. 蛋白質水解物與苦味的構效關系及脫苦研究. 食品科學，2006.27（10）：571-573
12. 何慧等. 靈芝生物活性肽的分離及組成研究，食品科學，2001，22（5）：56~57
13. 孫頡，何慧*等. 靈芝肽對實驗性糖尿病小鼠的治療作用，食品科學，2002，23（11）：133~135
14. 何慧等. 玉米醇溶蛋白膜在腌肉制品及果蔬中的保鮮作用研究，食品科學，2004.25（3）：184-187
15.何慧等，發酵靈芝粉水提物清除自由基及酶解水提法的研究，食品與發酵工業，2001，27（6）：11~15
16.何慧等. 靈芝肽對脂質氧化的抑制作用研究. 食品研究與開發. 2006，27（1）：8-10
17.何慧等. 靈芝中抑制羥基自由基活性成分及其提取條件研究，食用菌學報2003，10（4）：7-10
18. 何慧等. 靈芝水溶性小分子化合物的生物活性研究. 食用菌學報，2004.11 (3)：12-16
19. 何慧等. 發酵靈芝粉中膳食纖維的組成、活性及應用研究，食品研究與開發，2002，23（3）：27~28
20. 何慧等. 香菇中含氮化合物的提取研究，食品研究與開發，2003，24（4）：30~33
21. 何慧等，大豆蛋白和玉米蛋白酶解肽及其活性研究，糧油食品科技，2002，10（1）：14~16
22. 何慧等. 玉米醇溶蛋白保鮮膜成膜工藝的優化，糧油食品科技，2004.12（3）：7-8
23. 孫頡，何慧*等. 活性炭脫色對靈芝水提液活性成分的影響，化學工業與工程技術，2001，（1）：5-8
24. 謝筆鈞，何慧等. 以科研促教學，彰顯《食品化學與分析》精品課程特色. 中國科技信息，2005，（16）：180