1959年應邀回國參加中華人民共和國成立10周年國慶典禮。目睹了解放後祖國的巨大變化，也看到了家鄉的落後，於是捐款幫助家鄉建仙都小學。這開啟了他近半個世紀的慈善捐款來源。後來，在南岸碼頭仙都村，他又捐資200多萬元，修建仙都小學教學樓、碼頭中心幼兒園、村周邊水泥路。為南安醫院、南安中醫醫院、南橋醫院、婦幼保健院建設門診或病房樓；全資新建的柳城中學，在新校區內豎起了“招賢樓”(教師宿舍)、“賢都樓”(教學樓)、“集智樓”(學生宿舍)、食堂。在獅山中學修建銀華禮堂、仙都樓、集智樓、招賢樓、鹹宜樓(行政辦公樓)。鐘賢先生捐資30余萬元建設漳平實驗幼兒園，援建安溪壹中教學樓和長汀希望小學。從1991開始，設立壹年壹度的“福建黃仲賢文學獎”。他在南安創辦的黃仲賢教育基金會在南安開展了“堅持山區支教”、“優秀校長獎”、資助本科以上貧困學生入學、資助高中和初中貧困學生等廣泛的獎學金、支教、助學活動...截止2001年底，僅南安就發放助學金650多萬元，惠及師生65438人。加上捐建的教學點，南安的捐款已經過億。他捐資興建各種公益事業，教學樓40多棟，建築面積6萬平方米，但他淡泊名利，從不署名。大多以“仙都樓”命名，以紀念他出生長大的村莊。
2002年春節，他看望了泉州154貧困僑胞，給他們送上節日禮物，讓他們過個好春節。2002年5月底，他捐款20萬元，資助福建省老區貧困家庭的革命“五老”和革命烈士後代400名中學生。10多年來，南安碼頭仙都村60歲以上的老人，每年都有壹筆養老金，逢年過節還發紅包，安頓晚年。