本次大賽評委有建築師事務所總裁貝立中、香港著名平面設計師、深圳市平面設計協會學術委員、澳門理工學院藝術學院副教授陳、澳門設計師協會會長馮等。
設計采用立體透視構圖，不僅呈現了澳門科學館的主體建築形態，還巧妙地用線條勾勒出結構的內外兩面，充分表達了澳門科學館向公眾展示各種科學現象背後的本質和規律的使命。簡單的線條搭配，不僅看起來像壹本正在翻開，不斷向大眾傳播知識的書，還會給視覺感官帶來錯覺，造成上下和上下兩個發散的圖形。該設計具有向左和向右旋轉的雙重視覺效果，代表澳門科學館從多個角度向公眾展示科技的發展和應用。時任澳門行政長官何厚鏵在2002年澳門年度施政報告中提出，要培養澳門青少年的科普意識和推廣力度，希望提高澳門居民對科技普及的參與度，“讓廣大青少年在輕松愉快的環境中開闊視野，領略不可思議的科學奧秘”。因此，他打算在澳門建立壹個以教育為導向的科學博物館，並設立壹個科學展覽。
為加強澳門旅遊業和博彩業的發展，澳門政府於2002年3月派出澳門基金會赴美，邀請國際知名建築師貝聿銘和貝氏建築師事務所為澳門科技館設計建築。由澳門基金會興建的澳門科學館是壹座國際性的科學博物館。2002年，澳門基金會和特區政府派代表赴美，邀請貝聿銘繪制藍圖。基金會執行委員林錦程後來回憶說:貝先生對中國有著濃厚的感情，非常重視民族感情。他被澳門的誠意所感動，欣然接受了這個項目。由於澳門科學館希望其建築特色與香港太空館相似，貝聿銘和他的兒子貝立中於2004年底親自到澳門考察並設計。貝聿銘壹行主要參觀了澳門觀光塔63層的觀光層，與澳門政府有關部門就澳門科學館的景觀、交通、地理等進行了探討。貝聿銘提出了澳門科學館的選址，它位於澳門文化中心對面的海面上。他的建議也是在澳門當局的允許下寫在澳門觀光塔上的，他還親自為澳門科學館繪制了設計草圖。
2002年7月3日，澳門基金會主席吳等壹行赴美，與貝聿銘、貝氏建築師事務所起草了兩份澳門科學館的設計和建築設計合同，並對場地的交通、填海等技術問題進行了研究。同年9月26日，貝利代表建築師貝聿銘和貝的建築事務赴澳門，由財政局和澳門基金會正式簽署澳門科學館概念設計和建築設計兩份服務合同。次年2月26日，澳門基金會采納了澳門科學館的設計方案。
2005年6月5日+2月10日，澳門政府正式在澳門文化中心填海造地6.2萬平方米，用於建設澳門科學館。次年，10，19，澳門科學館主體建築工程正式啟動，2009年年中竣工。