壹般情況下司法是無權凍結社保卡個人賬戶余額的，但如果社保卡和工資卡是壹體的話，那麽就有可能會造成凍結社保卡的情況。通常，當事人社保卡（醫保卡）被法院凍結主要系因為職工社保卡（醫保卡）等多與當事人的工資卡為綁定關系，換言之，法院實則是凍結了當事人的工資卡，從而導致社保卡（醫保卡）等被限制使用。壹般是6個月會自動解凍。工資卡作為人們日常資金收入來源及儲蓄的憑證，工資卡中的資金屬於當事人的個人財產，屬於《最高人民法院關於人民法院民事執行中查封、扣押、凍結財產的規定》第壹條所規定的可由人民法院查封、扣押、凍結被執行人的動產、不動產及其他財產權。所以說法院是有權扣押凍結被執行人的工資卡的，所以如果工資卡和社保卡是壹起的話，那麽也就是相當於凍結了社保卡。
法院是不可以凍結個人社會保障卡的。因為社會保險基金是由社會保險機構代參保人員管理，並最終由參保人員享用的公***基金，不屬於社會保險機構所有。社會保險機構對該項基金設立專戶管理，專款專用，專項用於保障企業退休職工、失業人員的基本生活需要，屬專項資金，不得挪作他用。因此，各地人民法院在審理和執行民事、經濟糾紛案件時，不得查封、凍結或扣劃社會保險基金；不得用社會保險基金償還社會保險機構及其原下屬企業的債務。
法律依據：《中華人民***和國社會保險法》 第六十四條 社會保險基金包括基本養老保險基金、基本醫療保險基金、工傷保險基金、失業保險基金和生育保險基金。各項社會保險基金按照社會保險險種分別建賬，分賬核算，執行國家統壹的會計制度。社會保險基金專款專用，任何組織和個人不得侵占或者挪用。基本養老保險基金逐步實行全國統籌，其他社會保險基金逐步實行省級統籌，具體時間、步驟由國務院規定。