在分析合夥人如何繳納所得稅時，應當註意區分合夥人取得收入的類型。
合夥人取得收入的類型不同，適用的稅目和稅率也會不同。
具體說來，有限合夥制私募股權基金的收入主要原則兩大類：
(壹)從被投資企業取得的股息、紅利等權益性投資收益
在這種收入類型下，因合夥人的種類不同，在納稅上也有所差別。
1、合夥人為機構投資者的，應就該部分收入繳納企業所得稅。這也是159號文的直接規定，“合夥人是法人或其他組織的，繳納企業所得稅。”
但也有觀點認為，根據合夥企業“透明體”的特點和稅法原理，其收入在分配給合夥人時法律性質應當維持不變，因而機構投資者取得的該部分收入屬於《企業所得稅法》第二十六條第壹款第(二)項所述的“符合條件的居民企業之間的股息、紅利等權益性投資收益”，應當依據該條規定免征企業所得稅。至少目前來看，這種觀點很難在實踐中行得通。
2、合夥人為個人投資者的，依據84號文規定——合夥企業對外投資分回的利息或者股息、紅利，不並入企業的收入，而應單獨作為投資者個人取得的利息、股息、紅利所得，按“利息、股息、紅利所得”應稅項目計算繳納個人所得稅，這部分收入應當適用“利息、股息、紅利”稅目按照20%的稅率計算繳納個人所得稅。
3、合夥人為合夥企業的，由該合夥企業自然人合夥人按照5-35%稅率(比照個體工商戶生產經營所得)繳納個人所得稅，或公司合夥人依法繳納企業所得稅。
(二)轉讓被投資企業股權取得的收益
在這種收入類型下，合夥人的納稅情況同樣與合夥人種類有關。
1、合夥人為機構投資者的，應就這部分收入按照自身所得稅率繳納企業所得稅。
2、合夥人為個人投資者的，按照91號文的規定，應當按照“個體工商戶生產經營所得”稅適用5-35%超額累進稅率計算繳納個人所得稅，但按照天津和北京等地方政策，則可以按照“財產轉讓所得”稅目適用20%稅率計算繳納個人所得稅。
3、合夥人為合夥企業的，由該合夥企業自然人合夥人按照5-35%稅率(比照個體工商戶生產經營所得)繳納個人所得稅，或公司合夥人依法繳納企業所得稅。