根據上述職責，市商務局設19個職能處室：
（壹）辦公室
綜合協調機關日常工作；審核商務系統處級及以下人員因公出國（境）任務；負責機關文電、機要、保密、檔案、信訪、政務公開、固定資產管理、會務、接待和安全保衛等工作。
（二）組織人事處
負責局機關及所屬單位組織人事、機構編制、離退休人員管理服務工作；負責局機關和所屬單位因公出國（境）人員的審查；組織、指導全市商務系統的業務培訓工作。
（三）綜合法規處（掛行政審批處牌子）
提出商務發展戰略和政策建議；編制商務發展中長期規劃；組織重點課題調研；負責商務史誌和年鑒編撰工作；起草地方性法規、規章等規範性文件和重要文稿；承擔有關行政復議和行政應訴工作；統壹承辦本部門行政許可和非行政許可審批事項的辦理工作。
（四）財務審計處
會同有關部門管理中小企業國際市場開拓資金和商貿重點支持資金；監督管理中央外貿發展基金；按規定權限辦理全市企業出口退稅質押貸款相關業務；執行外貿進出口和商貿流通扶持政策；負責機關和所屬單位財務、審計和固定資產管理工作。
（五）市場秩序管理處（掛市12312商務舉報投訴服務中心牌子、商務行政執法辦公室牌子）
負責牽頭協調整頓和規範市場經濟秩序工作，擬訂規範流通秩序的政策措施；依法開展流通領域行政執法，參與打擊商務領域侵犯知識產權和商業欺詐行為；推動商務領域信用建設，指導商業信用銷售，建立市場誠信公***服務平臺；組織規範零售企業的促銷行為，指導開展行業誠信文明服務活動；承擔12312商務舉報投訴受理工作；負責酒類流通監督管理，並會同有關部門對直銷企業進行行業管理；負責職責範圍內的商場、超市安全生產監管工作。
（六）市場網點建設處
指導商業中心、商貿服務業集聚區、大中型商業網點、大型批發市場和商業街區項目建設，推進商貿流通網絡體系基礎設施建設；負責拍賣行業監督管理；按規定對再生資源回收、汽車流通、二手車市場、報廢汽車回收（含拆解）、舊貨流通進行監督管理。
（七）商貿服務業發展處
承擔商貿服務業行業管理工作；推動連鎖經營、物流配送、電子商務等現代流通方式的發展；指導流通企業改革、社區商業發展、流通領域節能降耗工作；負責典當行業的監督管理。
（八）市蔬菜副食品辦公室（掛市場運行調控處牌子）
負責監測分析全市生活必需品和消耗品市場供求情況，擬訂市場調控政策措施；負責生活必需品市場供應應急管理機制建設；組織協調生活必需品和消費品的儲備和供應；負責組織全市“菜籃子”和“三綠工程”建設；負責全市生豬等畜禽定點屠宰行業管理和屠宰活動的監督管理；承擔市重要商品市場調控工作領導小組辦公室和市“菜籃子”工程建設領導小組辦公室的日常工作。
（九）對外貿易處
協調管理全市外貿企業經營秩序；促進對外貿易經營者隊伍發展；指導出口商品廣告宣傳、商標和質量認證工作；實施出口商品的名牌發展戰略；跟蹤和分析進出口產品，優化出口產品結構；指導對外經濟貿易領域的中介組織和社會團體工作。
（十）外貿發展處
指導協調各類境外貿易促進機構建設，完善國際市場促銷網絡；宏觀指導和促進各類對外經濟技術貿易活動；組織境外推銷促進和境內采購洽談活動；推動網絡貿易、電子商務和國際連鎖采購等新型貿易方式發展。
（十壹）國際服務貿易處
擬訂全市外貿發展規劃及外貿平衡的政策、措施；監測分析外貿運行；負責全市進出口業務統計；協調財貿、銀貿、匯貿和信貿等合作；擬訂全市服務貿易和服務外包產業的發展政策、規劃，並組織實施；負責全市服務外包產業和相關服務貿易的統計分析；組織協調全市服務外包產業定向招商工作。
（十二）科技與機電處（掛市機電產品進出口辦公室牌子）
研究制定本市機電產品和高新技術產品進出口發展規劃；指導全市國家科技興貿創新基地、機電產品出口基地建設和商務系統科技創新工作，實施“科技興貿”戰略；協調大型成套設備出口信貸及出口信用保險項目；負責機電產品國際招投標活動的協調、監督；負責全市商務科技發展和技術進步。
（十三）公平貿易與產業損害調查處
研究提出我市進出口公平貿易應對措施並提供咨詢服務；組織協調涉及我市的反傾銷、反補貼和保障措施等進出口公平貿易工作及相關案件的應訴工作；建立全市進出口公平貿易預警機制；協助商務部開展對外貿易壁壘和產業損害調查；開展產業國際競爭力調查、產業恢復發展情況跟蹤與評估及產業安全應對工作。
（十四）外國投資管理處
管理全市利用外資工作，參與擬訂市外商投資產業指導目錄；負責外商投資企業設立的監督管理；依法監督檢查外商投資企業執行有關法律法規規章和合同章程的情況，指導、協調解決相關問題；指導外商投資企業進出口工作；負責省級以上經濟開發區的申報工作；指導協調本級各類經濟園區對外貿易經濟合作的規範化管理。
（十五）外商投資企業管理處(掛市外商投資企業協會牌子)
負責宣傳、貫徹有關外商投資企業的法規、政策；對外商投資企業依法經營進行指導、協調和服務；定期匯總、編報全市外商投資企業綜合情況；協調處理外商投資企業投訴和爭議調解工作。
（十六）對外經濟合作處
擬訂全市“走出去”發展規劃及鼓勵境外投資與經濟合作政策、措施；負責對全市境外投資實施監督管理；牽頭實施境外資源開發、產能轉移、跨國並購等境外投資合作；指導協調境外經貿合作區建設；負責境外投資統計及調研分析工作；負責對外承包工程、對外勞務合作和設計咨詢的監督管理；牽頭外派勞務和境外就業人員的權益保護工作，協助處置境外勞務糾紛和突發事件；負責全市對外援助工作；協調管理我市承辦的各類對外援助項目、多雙邊政府間經濟技術合作項目、聯合國及國外民間組織提供的無償援助和贈款項目。
（十七）投資促進壹處
（十八）投資促進二處
以上二個處職責：投資促進壹處負責組織協調全市對歐洲、美洲等國家（地區）投資促進活動；投資促進二處負責亞洲、非洲、大洋洲及香港、澳門特別行政區和臺灣地區的投資促進活動。負責與我國使領館及其駐華使領館商務部門的聯絡；負責相關區域國家（地區）經貿政策的調研和項目跟蹤，分析招商促進情況，提供經貿信息；參與相關區域國家（地區）重要團組接待、重大項目洽談和簽約工作。
（十九）信息化處
負責全局信息化、辦公自動化和網站建設工作；擬訂商務信息服務體系建設規劃、年度計劃並組織實施；貫徹落實國家有關運用電子商務開拓國內外市場的政策措施，推動商務流通企業電子商務運用；負責商務信息采編、管理工作；組織商務領域信息化建設的培訓、交流。
按規定設置紀委（掛監察室牌子）、機關黨委、工會和團委。