（二）各級財政部門要按照《會計基礎工作規範》（財會字〔1996〕19號）要求，配備政治素質好、有壹定專業知識的人員擔任財政專戶的會計、出納，有條件的地區還要配備稽核人員，建立健全財政專戶的內部管理機制。
1、會計人員的職責：負責財政專戶的會計核算工作；負責財政專戶內社會保障資金收支計劃的執行；負責社會保障資金支出用款計劃的審核；負責其他有關財政專戶的業務工作。
2、出納人員的職責：負責辦理社會保障資金繳存財政專戶的有關工作；負責撥付社會保障資金支出款項工作；負責其他有關財政專戶的業務工作。
3、會計和出納不得由壹人兼任。
4、各級財政部門要按時編制財政專戶資金月報和季報，年度終了後按照統壹的報表格式編制決算表。 （三）具體業務辦理時：
1、社會保險基金的繳存、撥付和結余管理按《社會保險基金財務制度》有關規定執行。
2、稅務機關或經辦機構按規定的時間或定額將征集的社會保險基金繳存財政專戶後，財政部門應於當日登記入賬。每月終了前，財政部門根據社會保險基金收支計劃，及時通知稅務機關或經辦機構將社會保險基金收入繳存財政專戶；未按規定執行的，財政部門應委托各開戶銀行或國庫將社會保險基金收入全部劃入財政專戶。
3、財政部門應根據社會保險基金收支計劃，並結合繳存財政專戶情況，對經辦機構的用款申請審核無誤後，必須在規定的時間內將資金從財政專戶撥入支出戶，不得延誤。
4、財政專戶內社會保險基金未經經辦機構提出用款、購買國債或轉存定期存款申請，壹律不得隨意動用。
5、預算和預算外資金安排的國有企業下崗職工基本生活保障和再就業等其他非基金性質的資金補助額度確定後，財政部門應及時填制預算撥款單或劃款憑證，並將資金從國庫或相關的預算外資金專戶轉入財政專戶。
6、財政專戶內各項資金的結余除按規定購買國債和轉存定期存款以外，全部結轉下年度繼續使用，不得改變用途。
7、財政專戶內的銀行存款按照中國人民銀行規定的存款利率計息，個別類型的資金，如醫療保險基金、企業養老保險基金等應按人民銀行規定的優惠利率執行。
8、財政專戶發生的繳存和撥付業務，都必須通過銀行轉賬劃撥，不得以現金的形式繳付。
9、財政專戶發生繳存和撥付業務時，應憑原始憑證記賬，並出具財政專戶繳撥憑證，附加蓋專用印章的原始憑證復印件，交有關部門或單位記賬和備查。
10、財政預算安排的用於補助下級的社會保障補助資金應通過國庫結算，不得通過上下級財政專戶辦理繳撥手續。