使用規則
(1)本制度統壹規定了會計科目的編號，便於編制會計憑證、登記賬簿、查閱賬目和實行會計電算化。醫院不應隨意改變或擾亂重組。
(二)醫院應按本制度的規定設置和使用會計科目。明細科目的設置，除本制度已有規定外，在不違背統壹核算要求的情況下，可由醫院根據需要自行規定。
(3)醫院在填制會計憑證和登記簿時，應填寫會計科目名稱，或同時填寫會計科目名稱和編號，不應只填賬號，不填戶名。
財務報表
(1)醫院應當按照《事業單位會計準則》和本制度的規定，編制和提供合法、真實、公允的財務報告。
(2)醫院的財務報告由會計報表和財務報表組成。醫院提供的財務報告內容，會計報表的種類和格式等。應由本制度規定；醫院內部管理所需的會計報表由醫院自行規定。
(三)醫院提供的會計報表包括:
1，資產負債表；
2.收入和支出匯總表；
3.資金變動表；
4.相關時間表。
(4)醫院的財務報告應報送財政部門和主管部門，報送時間由各省、自治區、直轄市財政部門和衛生部門規定。
(五)醫院會計報表，以人民幣“元”為金額單位，“元”以下以“分”填列。
(六)醫院提供的會計報表應依次編號，有封面，裝訂成冊並加蓋公章。封面應註明醫院的名稱和地址、報告的年、月、送達日期，並由醫院法定代表人、總會計師(或代理總會計師的人員)和會計機構負責人簽字或蓋章。
主題分類編輯
資產類
反映醫院全部資產的總帳科目按資金流動性分為現金、銀行存款、其他貨幣資金、應收票據、應收住院病人醫療費、醫療應收款、其他應收款、壞賬準備、庫存材料、在產品、待攤費用等。
債務
反映醫院負債總額的總賬科目，根據債權人和債務種類的不同，分為醫療預收款、應付票據、應付賬款、其他應付款、應付工資、應付福利費、應付社會保障、應付藥品收入、預提費用、長期應付款等科目。
基金類別
反映醫院各項資金狀況的總帳科目，按資金用途分為“公用基金”、“專用基金”、“待沖基金”、“收支平衡”、“結余分配”等科目。
收入和支出類別
反映醫院總收入和總支出的總帳科目，按收入來源和去向分為醫療收入、醫療業務成本、其他收入、其他支出、財政補助收入、財政補助支出、科教項目收入、科教項目支出、管理費用和投資收入。
會計科目表編輯
資產類
序列號帳戶名稱
01 101現金
02 102銀行存款
03 109其他貨幣資金
04 111應收住院病人醫療費用
05 113醫療應收款
06 114壞賬準備
07 119其他應收款
08 121藥品
09 122藥品購銷差價
10 123庫存材料
11 125加工材料
12 131待攤費用
13 141對外投資
14 151固定資產
15在建工程
16 161無形資產
17 171開辦費
18 181待處理財產的損失和溢出
債務
19 201短期貸款
20 202應付賬款
21 204預收醫療款
22 205應付工資
23 207應付社會保障款項
24 209其他應付款
25 211到期多付
26 221預提費用
27 231長期貸款
28 241長期應付款
凈資產類別
29 301業務基金
30 302固定基金
31 303專項基金
32 305收支平衡
33 306余額分配
收入和支出類別
34 401財政補貼收入
35 402上級補助收入
36 403醫療收入
37 404藥品收入
38 409其他收入
39 411醫療支出
40 412藥品支出
41 415管理費
42 416財政專項支出
43 419其他費用
特定編輯
《醫院會計制度》對收入和支出的壹級、二級明細科目做了具體規定。
醫療收入的明細科目設置是:
門診收入
提供門診和急診服務的收入。包括掛號收入、考試收入、檢查收入、治療收入、其他收入等二級明細科目。
住院收入
為住院病人提供醫療服務的收入。包括床位收入、檢查收入、檢查收入、治療收入、用於門診、急診和住院醫療服務的藥品銷售收入，分別設置西藥收入、中成藥收入、中藥材收入等二級明細科目。
其他科目
醫院會計制度中明確規定了會計科目的內容、記賬方法和核算方法。