1、轉出靈活度：理財通只可“安全卡贖回”
余額寶內資金可實時用於網上購物、轉賬、信用卡還款、充話費，也可以轉回到支付寶賬戶余額或銀行卡，在電腦和手機上均可自如操作，資金流動性好於銀行定期存款，取出的時間也沒有限制。壹般來說，5萬元以下可以在2小時內到賬，對於5萬元以上的資金來說，建議先轉出到支付寶，再提現到銀行卡，超過額度的部分只能直接轉出到銀行卡，如果選擇2小時到賬，要加收0.2%的加急費用。
理財通只能轉出到壹張銀行卡內，且“僅可使用安全卡購買贖回”。理財通第壹筆購買使用的銀行卡將作為理財通安全卡，資金僅可使用此卡進行購買與贖回。單次贖回限額為5萬元，每天可以贖回5次，每月贖回的限額為100萬元。從到賬時間來看，微信理財通支持工行、農行、建行等11家銀行2小時到賬，其他銀行1~3天內到賬。
2、使用便利性： 余額寶限制較少
余額寶號稱在電腦和手機上都可以方便地“立即開通”，但在開通余額寶時，無論在電腦還是手機上都遇到了“需要上傳身份證照片驗證身份”的要求，並且需要兩天的審核時間。從轉入額度上來看，余額寶最少1元錢就可以轉入。從最大限額來看，支付寶“快捷支付”轉賬功能各銀行每天都有限額，如交行20000元，光大20000元，工行2000元等。如果需要轉入更多，可以在電腦用網銀為支付寶充值再轉入余額寶，比如用工行U盾每天的限額是200萬，但目前余額寶要求轉入後總額持有不超過100萬元。
3、收益率：理財通理想收益更高
從理財通公布的收益率來看，則可以“讓資產增值更快，收益率可達活期16倍以上。”。理財通陣容堪稱豪華，首批合作夥伴包括華夏、易方達、廣發、匯添富4家基金公司，2月16日的7日年化收益率為6.5430%，超過了余額寶。
4、最大區別：余額寶的資金可與支付寶自由轉換，而理財寶只能和銀行卡轉出入。
擴展資料：
兩者***同缺點：
安全與風險高
1、從安全保障上來看，理財通和余額寶都提供了“資金保障服務”，余額寶宣稱“資金被盜全額補償”，理財通則由PICC全額投保。然而在余額寶《協議》中明確規定：“對非本公司原因造成的賬戶、密碼等信息被冒用、盜用或非法使用，由此引起的壹切風險、責任、損失、費用等應由投資者自行承擔。”而理財通也稱“PICC全額投保”。
2、余額寶可以直接用來消費、購物，但理財通不可以。理財通的《協議》中也規定對於“受到計算機病毒、木馬或其他惡意程序、黑客攻擊的破壞，用戶或財付通公司的電腦軟件、系統、硬件和通信線路出現故障”的情況是免責的，讓使用者仍然感到“心裏沒底”。從資金收益來看，法律規定貨幣基金不允許保證“壹定盈利”，長期來看，余額寶、理財通的高收益只是壹個階段性現象。作為貨幣基金的余額寶、理財通等的風險與宏觀經濟運行形勢直接相關。經濟形勢不佳時，其風險自然大增。
參考資料：