挪用專項資金是指按照“專款專用”的規定，擅自改變專項資金的用途。主要表現在以下幾個方面:
1.混合核算經常性資金和項目資金，挪用專項資金。
壹些高校由於預算意識差，經常性資金超預算、超標準支出，導致費用大量超支。但政府撥給該項目的專項資金未按相關文件要求使用，造成專項資金大量結余。將專項資金結余轉為經常性資金，有意將經常性資金與專項資金混在壹起核算，從中渾水摸魚，即在同壹會計科目中，將專項資金結余彌補經常性資金超支，統壹結轉到年末經常性資金結余賬戶，擠占挪用專項資金。
2.將專項資金結余轉為單位資金挪用專項資金。
壹些高校雖然按照相關會計制度對專項資金單獨核算，不直接將不屬於專項資金範圍的支出列為專項支出，但采取另壹種方法擠占挪用專項資金，即不按預算規定使用財政專項資金，人為調整專項資金余額。然後轉入單位經常基金，即結轉年終經常基金以維持收支平衡，當專項基金余額較大時，人為調整增加單位公用基金作為單位資金的“蓄水池”，以後年度資金超支時再轉入彌補超支。
3.經常性資金超支或業務支出挪用專項資金。
部分高校采用間接方式擠占挪用專項資金。其操作的主要方法是:壹是專項資金撥付後，在形式上單獨核算收支和結余。但未按規定設立專項資金專用賬戶，專項資金和經常性資金同時存放在壹個銀行存款賬戶中。然後以收取經常性支出為由，將違規使用結余的專項資金列為經常性支出核算，造成經常性支出大量超支。不是直接計入專項資金，從賬面上反映經常性資金的超額支出，實際上是以專項資金結余的銀行存款形式出現的經常性資金超額支出，間接占用和挪用專項資金。