1.如果在門診做腸鏡，患者只能通過個人賬戶支付，不能使用醫保統籌賬戶報銷。
2.如果醫療保險個人賬戶余額不足，參保人只能自行支付相關醫療費用。
3.因重特大疾病住院的，住院診療期間需要進行腸鏡檢查，符合《社會保險法》第二十八條規定的，按照國家規定從基本醫療保險基金中支付。這個時候腸鏡可以通過醫保報銷。
新型農村合作醫療保險與城鎮醫療保險的區別如下:
1，人群不同。城鎮居民醫保主要覆蓋城鎮戶口居民，新農合主要覆蓋農村戶口居民；
2.不同的管理部門。城鎮居民醫保主要由人社部門管理，新農合大部分地方由衛生部門管理；
3.購買方式不同。新農合是購買農村戶口，居民醫保是購買非農業戶口；
4.報銷比例不壹樣。城鎮居民醫保報銷比例為85%。根據醫院級別不同，新農合報銷比例從10%到80%不等。
5.報銷的藥物不同。新農合可報銷的藥品目錄比城鎮醫保少，新農合在鄉鎮衛生院報銷比例高。市級醫院平均報銷比例比城鎮醫保低10%-20%，最高後蓋也比城鎮醫保少。
6.安全處理的側重點不同。城鎮居民醫保主要同時覆蓋住院和門診大病，因此住院和門診大病待遇高於新農合。此外，新農合門診待遇水平普遍高於城鎮居民醫保。
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法律依據:《中華人民共和國社會保險法》。
第二十四條國家建立和完善新型農村合作醫療制度。新型農村合作醫療管理辦法由國務院制定。
第二十八條符合基本醫療保險藥品目錄、診療項目、醫療服務設施標準和急診、搶救的醫療費用，按照國家規定由基本醫療保險基金支付。
第二十九條參保人員的醫療費用應由基本醫療保險基金支付的，由社會保險經辦機構與醫療機構、藥品經營單位直接結算。社會保險行政部門和衛生行政部門應當建立異地醫療費用結算制度，方便參保人員享受基本醫療保險待遇。
第五十八條用人單位應當自用工之日起30日內，向社會保險經辦機構申請為職工辦理社會保險登記。未辦理社會保險登記的，由社會保險經辦機構核定其應繳納的社會保險費。自願參加社會保險的無雇工個體工商戶、不在用人單位參加社會保險的非全日制從業人員和其他靈活就業人員，應當向社會保險經辦機構申請辦理社會保險登記。國家建立全國統壹的個人社會保障號碼。個人社會保障號是公民的身份號碼。