1，公積金貸款利率低，商業貸款利率高:
(1)公積金首套房:貸款利率執行基準利率，即使用年限1-5年，利率2.75%；使用年限6-30年，利率3.25%；
(2)公積金二套房:貸款利率為基準利率的1.1倍，即使用年限為1-5年，利率為3.025%；使用年限6-30年，利率3.575%；
2.首付比例不同，公積金首付比例低:
(1)有公積金的客戶，首套房首付比例壹般為20%；二套房40%或50%；
(2)對於其他沒有公積金的客戶，根據其資質，首付比例壹般為25%或30%；二套房首付50%或60%，各城市首付政策不同。
3.貸款額度不同，公積金受額度影響:
(1)公積金貸款有額度要求。有些地方單職工只能貸1.5-0.5萬，雙職工壹般和當地房價掛鉤，高很多。有的根據余額設置額度，壹般為額度的10到15倍不等；
(2)商業貸款壹般不受影響。
4.月供和還款方式不同:
(1)如果是公積金貸款，在很多城市，可以直接用每月的公積金抵扣月供，不足部分可以補足；
(2)如果是商業貸款，月供不能從繳納的公積金中扣除，月供只能用自己的錢還。
5.貸款流程不壹樣，公積金相對麻煩:
(1)商業貸款壹般是購房者向銀行申請貸款，開發公司為購房者擔保。如果他們符合要求，他們可以貸款。
(2)公積金貸款需要先向公積金管理中心申請，公積金中心審批通過後才能委托銀行審批，符合條件的才能放款。
6.妳可以提前還貸:
(1)住房公積金貸款正常還款半年後，可以提前還款。也就是說，妳可以提前部分還款，也可以全款還清，提前還款是沒有違約金的。公積金貸款提前還款政策寬松，不受時間、金額、次數限制。借款人可以隨時提前還款，不向借款人收取任何費用。
(2)商業貸款提前還貸壹般需要壹定的違約金。
法律依據:《住房公積金管理條例》第二十六條。
繳存住房公積金的職工，在購買、建造、翻建、大修自有住房時，可以向住房公積金管理中心申請住房公積金貸款。
住房公積金管理中心應當自受理申請之日起15日內作出是否發放貸款的決定，並通知申請人；準予貸款的，受委托銀行應當辦理貸款手續。
住房公積金貸款風險由住房公積金管理中心承擔。