在伊朗伊斯蘭革命發生後，俱樂部班主艾布杜離開伊朗，並回到美國。期間，雖然球隊贏得了薩義德·艾士潘迪杯，但很多球員都離開了俱樂部。另外，俱樂部的資產暫時交由“壓迫者和退伍軍人基金會”(波斯語:? ? ) 打理，並把俱樂部的營運權交予“伊朗體育部”。
1981年，體育部宣布將會更改俱樂部的名稱，但俱樂部職員、球員及球迷均強烈反對。而且，球隊於壹場省聯賽關鍵之役罷賽，以示其反對的決心。最終球隊根據條例被罰3分，無緣冠軍。1986年，“壓迫者和退伍軍人基金會”重新接掌俱樂部所有權力後，宣布改名為阿薩迪(波斯語:?，意即自由)。球員於是再次宣布如果俱樂部更改名字，將會再次罷賽。後來，基金會決定放棄俱樂部，並把俱樂部壹切重新交回體育部手上。1987年2月16日，得到球員的同意後，體育部正式把俱樂部的名字改為皮魯茲(波斯語:?，意即勝利)。話雖如此，但所有球迷均沿用其舊稱，波斯波利斯。
由於1980年代伊朗政治不穩，俱樂部只能於省級的比賽中競賽。在球員兼主教練柏文的帶領下，俱樂部奪得6屆德黑蘭省聯賽冠軍（其中1984-89年獲五連冠）及德黑蘭哈茲菲杯冠軍，成績驕人。這時的波斯波利斯是德黑蘭的壹級強隊，宿敵埃斯特拉爾則相對顯得暗淡無光。 1990年代是波斯波利斯的壹個輝煌年代，球隊總***奪得了4屆聯賽冠軍及兩屆哈茲菲杯冠軍。加上有大批優良球員湧現，讓所有波斯波利斯的球迷看到了1960年代及1970年代的那支夢幻球隊的影子。1991年，球隊更成為首屆亞洲優勝者杯冠軍，波斯波利斯在兩回合制的決賽以1-0擊敗來自巴林的球隊穆哈拉克。這亦是球隊在洲際比賽的第壹個冠軍。
1997年波斯波利斯的陣容
球隊贏得1995-96年賽季的聯賽冠軍後，國內足球迷重新把註意力放回波斯波利斯身上。這季俱樂部原本以10分落後領頭羊，但球隊憑著永不放棄的精神反敗為勝，奪回失落多年的聯賽冠軍。在下壹個賽季，球隊更成功衛冕伊朗足球甲級聯賽，領先第二名的球隊6分奪冠。在亞洲賽場上，球隊亦打入了亞洲俱樂部錦標賽半決賽，但被韓國球隊浦項制鐵淘汰，最後只能獲得第三名。
在1997-98年賽季，波斯波利斯繼續向國內戰場及亞洲賽場的冠軍進發。但由於伊朗足球協會與亞洲足聯未能就賽程達成***識，賽事過度頻密的關系，在聯賽球隊只能奪得季軍。在其後舉行的亞洲俱樂部錦標賽中，波斯波利斯亦未能取得好成績，最後被中國俱樂部大連萬達淘汰，只得第四名。這段時期，波斯波利斯亦為伊朗國家足球隊提供阿貝紮迪赫、巴希利、霍達達德·阿齊茲、阿裏·戴伊及馬達維基亞等不少出色球員。
1998年世界杯後，雖然球隊大量優秀球員相繼被歐洲俱樂部挖角，但球隊仍然保持隊型，並邀得阿裏·卡裏米加盟。球隊更在1998-99年賽季成為雙冠王，壹舉奪得聯賽冠軍及哈茲菲杯冠軍。在其後的壹個賽季，球隊再次成為冠軍，奪得俱樂部最後壹個甲級聯賽冠軍。可是，在亞洲賽場，球隊再次奪得亞洲俱樂部錦標賽季軍，未能突破俱樂部最佳的成績。 波斯波利斯2001年晉身新成立的伊朗職業足球聯賽並再壹次奪得冠軍，但過程卻相當驚險。最後壹輪比賽前，球隊的宿敵埃斯特拉爾還以兩分領先波斯波利斯，但最後壹輪卻落敗了。反之，波斯波利斯最後壹輪擊敗對手，並以壹分反壓埃斯特拉爾成為第壹屆職業聯賽冠軍。下壹屆球隊便沒有那麽幸運，聯賽的過程十分艱巨。塞帕漢奪得了聯賽冠軍，而俱樂部只能奪得第三名。另外，球隊在改革後的亞足聯冠軍聯賽中，亦未能突破小組賽階段，小組賽出局。
及後，俱樂部新主席阿克巴爾·格鹹哈上任後，他作出了壹系列承諾，並開始改革球隊。他公開了球員的薪金，嚴重地激怒了主帥柏文，最終柏文掛冠而去。格鹹哈及後聘請了克羅地亞籍主教練比高域，開始大灑金錢，購買壹些出色的球員。雖然球隊於2003-04年有壹個很好的起步，但最終失敗而回。比高域因此被解除職務，由德國人索貝爾取代其職位。索貝爾上任後，球隊仍然未能於2004-05年奪得聯賽冠軍，索貝爾被逼離去，主席格鹹哈亦於此時下臺。
賀紮杜拉·哈提蔔成為俱樂部新的主席後，再次邀請俱樂部史上最成功的主教練柏文回巢執教。這時，俱樂部的財政問題開始浮現，但哈提蔔卻無法化解今次由上任主席格鹹哈的揮霍而遺留下來的問題。波斯波利斯於2005-06年賽季竟然了俱樂部史上最差的第9名完成賽事，柏文亦再次辭職而去。
哈提蔔於是辭去主席壹職，由俱樂部董事局選出安薩裏法德成為俱樂部新主席。安薩裏法德亦聘請了阿裏·哈恩成為俱樂部新任主帥，哈恩亦成功帶領俱樂部晉身哈茲菲杯決賽，但在決賽開始前卻因與俱樂部管理層意見不合而被炒了。土耳其人丹尼斯利與波斯波利斯會方於2006年8月17日簽約，成為新壹任主帥。丹尼斯利的第壹個任務就是帶領俱樂部捧杯，可是俱樂部未能於2006年的哈茲菲杯決賽捧杯，失去參加亞足聯冠軍聯賽的機會，失去參加壹個可以改善俱樂部財政困難的比賽的資格。丹尼斯利於下年的聯賽只能取得第三名，加上哈茲菲杯於半決賽出局。於是丹尼斯利只能跟隨主席安薩裏法德，在俱樂部的歷史上為自己畫上句號。