所屬類型不同：混合型基金屬於主動型基金；指數基金屬於被動型基金。
投資目的不同：混合型基金追求超越市場的收益；指數基金不追求超越市場的收益。
投資標的不同：混合基金沒有明確的投資方向，可以同時投資股票、債券、貨幣市場；指數基金以特定的指數為跟蹤對象，買入指數中全部或者部分成份股。
混合基金是指同時投資於股票、債券和貨幣市場等工具，沒有明確的投資方向的基金。其風險低於股票基金，預期收益則高於債券基金。它為投資者提供了壹種在不同資產之間進行分散投資的工具，比較適合較為保守的投資者。
混合基金是以合夥法律形式聚合投資者資金的壹種基金形式。例如，由壹家銀行或保險公司來組織資金，從中收取費用。典型的合夥人包括信托或退休帳戶，它們擁有的資產組合遠大於個人投資者，但如果進行獨立管理，規模仍嫌小。
在形式上，混合基金與開放基金很相似，但它不以基金股份作為投資載體，而是提供壹種可以以凈資產價格買賣的基金單位。銀行或保險公司會提供大量不同的混合基金供信托或退休帳戶選擇。例如，貨幣市場基金、債券基金和普通股基金。
混合基金根據資產投資比例及其投資策略再分為偏股型基金（股票配置比例50%-70%，債券比例在20%-40%）、偏債型基金（與偏股型基金正好相反）、平衡型基金（股票、債券比例比較平均，大致在40%-60%左右）和配置型基金（股債比例按市場狀況進行調整）等。
指數基金(Index Fund)，顧名思義就是以特定指數（如滬深300指數、標普500指數、納斯達克100指數、日經225指數等）為標的指數，並以該指數的成份股為投資對象，通過購買該指數的全部或部分成份股構建投資組合，以追蹤標的指數表現的基金產品。
指數基金是以特定的指數為標的指數，並以該指數的成份股為投資對象，通過購買該指數的全部或部分成份股構建投資組合，以追蹤標的指數表現的基金產品。目前市面上比較主流的標的指數有滬深300指數、標普500指數、納斯達克100指數等。投資服務機構Portfolio Solutions和Betterment曾經發布研究報告，分析持有10種資產的投資組合在1997年至2012年間的表現。結果發現，指數基金投資在82%到90%的情況下，表現好於主動管理投資。