借:應收特別捐款-本年，
應收特別捐款-遞延，
普通基金應收款，
貸款:資金余額，
(二)發行專項債券，
由於特別稅基金項目所需資金數額巨大，且特別稅的征收壹般在項目完成後開始，並持續多年，因此通常通過發行特別稅債券來籌集必要的資金。按面值發行債券時，會計分錄為:
借:現金，
貸款:應付債券溢價，
發行時的會計分錄為:
借:現金，
貸款:應付債券，
債券溢價，
折價的會計分錄是:
借:現金債券貼現，
貸款:應付債券，
(3)工程費用、
壹般改善項目或其他項目開始後，會發生材料訂貨、工程承包等各種費用，在會計上要做相應的處理。由於項目跨越不同的年份，壹般采用權責發生制，根據支出準備金核算訂單或合同成本。
訂購材料時，會計分錄如下:
借:支出準備金，
貸:支出準備金，
收到訂購材料後，會計分錄如下:
借:支出，
貸:應付憑證，
借:支出準備金，
貸:支出留成，
與承包商簽訂項目合同時的會計分錄如下:
借:支出準備金，
貸:支出準備金，
收到承包商的部分完工賬單時的會計分錄如下:
借:支出，
貸款:應付合同價款。
借:支出準備金，
貸:支出留成，
(4)征收特別稅及利息，
如前所述，應收專項款分為兩部分:本年款和延期款。會計在收到本年應收專項款和政府分成款時，應作相應處理。此外，項目受益人因分期支付專項款而應承擔的利息費用也應作相應處理。。本年收到專項應收稅款和政府支付款項時的會計分錄如下:
借:現金，
貸:應收專項捐款——本年，
普通基金應收款，
計算特殊納稅人應負擔的債券利息時的會計分錄如下:
借:應收利息，
貸款:利息收入，
收到應收利息時，會計分錄為:借記:現金，貸記:應收利息，
(5)專項債券本息的償還，
專項債券應計算利息費用；同時，有溢價或折價金額的，應當攤銷；支付本息時，應付債券和應付利息應相互抵銷。
按面值發行的利息費用分錄如下:
借:利息支出，
貸款:應付利息，
溢價發行的利息費用和溢價的攤銷分錄如下:
借:債券溢價，
貸款:利息支出，
應付利息，
貼現時利息費用和貼現的攤銷分錄如下:
借:利息支出，
貸款:債券貼現，
應付利息，
債券還本付息的會計分錄如下:
借:應付債券，
應付利息，
貸:現金(或應付憑證)，
(六)項目竣工年度終了和年終結算時，結清利息收入、利息支出和其他費用賬戶；項目完成後，還應進行相關的會計處理。利息收入和利息費用賬戶年末結賬分為利息收入超過利息費用和利息費用超過利息收入兩種情況。
利息收入超過利息支出，會計分錄為:
借:利息收入，
貸款:利息支出，
資金余額，
當利息費用超過利息收入時，會計分錄為:
借:利息收入，
資金余額，
貸款:利息費用年度，
結束支出和支出保留的會計分錄如下:
借方:資金余額，
貸款:支出，
支出預留，
此外，如果有必要確定已完工項目的金額，會計分錄如下:
借:在建工程(支出金額)，
貸:長期資產投資-專項撥款，
項目全部驗收完畢後，可按完工資產類別轉入長期資產相關項目，會計分錄如下:
借:長期資產-XX類，
貸款:在建工程(以前年度支出)，
長期投資-特別津貼(年度完工支出)。