根據《宜昌市疾病預防控制中心關於申報第二周期重點專科的通知 》規定，經各所科室申報，中心學術委員會審核，中心黨委審批，現確認下列專業為中心重點專科，有效期為2010年至2014年。
傳染病防治專科 衛生檢驗專科 病媒生物防制專科
職業病防治專科 健康教育專科 免疫預防專科
結核病防治專科
其中病媒生物防治與衛生檢驗為市衛生局批準設立的2個市級重點專科。
重點專科工作開展情況：
（壹）、基礎資料完整規範
各專科制定了切實可行的周期發展規劃和年度計劃目標及確保實現目標的措施，認真對照中心重點專科考核評分標準進行了自查打分，並按照統壹格式撰寫了周期工作總結，原始資料規範完整。
（二）、基本條件明顯改善
中心利用各類項目資金以及市衛生局重點專科建設專項撥款投資近180萬元新建和改建了微生物實驗室和理化實驗室，使實驗室結構更趨於合理、實用。完成了分子生物學實驗室（PCR實驗室）、寄生蟲病室、結核病參比實驗室的新建，HIV確認中心實驗室在全省地市級疾控中心率先通過評審驗收。完善了血清學實驗室，腸道菌實驗室，食源性病原菌分離鑒定實驗室，地方病實驗室，消毒實驗室，食品、化妝品、水質、涉水產品等健康相關產品微生物實驗室，黴菌分離及鑒定實驗室，職業衛生檢測室，常見化學毒物檢測實驗室，普通理化實驗室等10個實驗室。最終達到14個專業功能實驗室，完成了建設周期內的目標。利用項目資金和業務收入近400萬元購置了氣質聯用儀、液相色譜儀、石墨爐原子吸收儀、流式細胞儀、全自動生化分析儀、全自動微生物熒光酶標免疫測試系統、病毒載量儀、熒光PCR擴增儀等大型設備。衛生檢驗專科的硬件設施得到了明顯的增強。
病媒生物防治專科的動物標本展廳已添置空調、除濕機等設備，已完成病媒生物監測室、飼養室（壹馬路工作區）的擴建裝修工作，下壹步將完善有關實驗條件和器材,對動物標本室改造已形成初步的方案和預算，有關事宜正在招標洽談中。
職業病防治專科按照《職業衛生技術服務機構資質規範》、《職業健康檢查機構和職業病診斷機構資質規範》建設的要求，通過購置、配備和項目投入，添置和更新了壹大批現場檢測、檢驗、體檢等新型設備，基本實現了主要設備的更新換代工作，種類齊全、性能良好，發揮了相應作用。
健康教育專科業務用房明顯改善，投資10萬元新擴建健康教育培訓室和資料庫、新建健康教育電腦培訓室，建立了“公民健康素養基本知識與技能”展板宣傳長廊。辦公面積超過500平方米，能滿足實際工作需要。現有工作電腦、數碼照相機、彩色打印機、攝像機、多媒體投影儀、打印復印傳真多功能機、非線攝錄編系統、錄放機、電視機等20多種設備器材，價值30多萬元，辦公基本實現自動化。
傳染病防治與免疫預防2個專科***配備有筆記本電腦5臺，臺式電腦11臺，打印機8臺，復印機1臺，數碼照相機2部，投影儀1臺。
（三）、科研能力逐步提高
各重點專科充分發揮專科優勢，積極申報和承擔重大科研項目與疾控工作項目。3年來，6個重點專科***申報並獲批了2項省衛生廳重點資助項目，2項省衛生廳指導項目，9項宜昌市計劃項目。1項課題獲市人民政府科技進步二等獎，2項課題獲市人民政府科技進步三等獎。主持或參與的***2項課題通過鑒定達國際先進水平，主持的4項課題通過鑒定達國內領先水平。
傳染病防治專科研究的科研課題《法定傳染病變化趨勢與預測模型研究》2007年獲得湖北省重大科研成果、宜昌市科研成果、宜昌市政府科學技術進步三等獎；檢驗專科完成的“宜昌市食品化學汙染物及食源性致病菌動態監測分析”項目於2008年獲得宜昌市人民政府科技進步二等獎；免疫預防專科參與的《生產性黃磷中毒的發病機制及生物標誌物研究》獲省衛生廳重大科技成果證書。並獲宜昌市科技進步三等獎。
傳染病防治專科發揮人才優勢，積極申報並獲批準湖北省衛生廳重點科研基金項目《宜昌市三峽庫區人群健康監測及重點疾病流行病學研究》，已按計劃實施完成。