深股通是指投資者委托香港券商通過香港聯合交易所在深圳設立的證券交易服務公司向深交所申報，在深股通規定的範圍內買賣在深交所上市的股票。
與此對應的是深港通，是深港股票市場交易互聯互通機制的簡稱。它是指在深圳證券交易所和香港聯合交易所有限公司之間建立技術連接，使內地和香港投資者可以通過當地證券公司或券商在規定範圍內買賣對方交易所上市的股票。
港股通和深股通的區別主要是品種、運行機制和路徑。
1.品種不同，深港通投資標的品種更多。
與滬港通相比，深港通下的港股通增加了市值50億港元及以上的恒生綜合小盤指數成份股。據業內估計，目前已有超過100只港股擴容進入深港通，相關資金的投資選擇增加。
2.運行機制不同。深港通和滬港通采用“雙通道”獨立運行機制。
投資者通過深港通下的港股通賬戶買入港股通股票，但不能通過滬港通下的港股通賬戶賣出，只能通過原買入賬戶賣出。
3.不同的道路
深股通意味著資金北上(相對於香港)；
深港通是資本南下(相對於內地)。
中國證監會30日發布《內地與香港股票市場交易互聯互通機制規定》，自發布之日起施行。
互聯互通條例遵循法律法規的適用原則，各類市場主體的權利、義務和責任等。在2014年6月發布的《關於滬港股票市場交易互聯互通機制試點的若幹規定》中。
相比較而言，變化主要包括以下三個方面:
壹是將適用範圍從滬港通擴大到滬港通和深港通；
二是明確滬港通、深港通投資者適當性管理遵循屬地管理原則。比如，投資者委托香港券商買賣深股通股票，必須遵守香港而非內地的投資者適當性監管規定和業務規則；
第三，為未來貨幣兌換機制的完善預留制度空間。