徐州市疾病預防控制中心是在原徐州市衛生防疫站、健康教育所、皮膚病研究所的基礎上，於2002年4月成立的國家級機構。
是對重大傳染病實施政府控制的專業機構。主要負責全市疾病預防控制、突發公共衛生事件應急處理、疫情和健康相關因素信息管理、健康危害因素監測與控制、實驗室檢測分析與評價、健康教育與健康促進、技術指導與培訓、科學技術應用研究等工作。
實驗辦公樓共12層，包括1 GC、4 GC、2 HPLC、1 GFAAS、1離子色譜儀、2 AFS、1大容量旋轉蒸發器、1蛋白質印跡儀。
儀器設備正按照衛生部的統壹標準進壹步配備，以更好地滿足公共衛生監測和技術服務的需要。建立了疾病控制信息網站。與高等院校緊密合作，成為南京醫科大學等高校的MPH健康碩士教學基地；國家分子生物學網絡設備實驗室，衛生部細菌分子生物學重點網絡實驗室。