醫院現有職工近3973人。九院現擁有三位中國工程院院士:著名骨科專家張、口腔頜面外科專家邱、骨科專家戴克榮教授。截止2014和12年末,碩士生導師158人,博士生導師88人,博士後流動站3個,博士點19個,碩士點28個。
上海交通大學醫學院附屬第九人民醫院的前身伯特利醫院,創建於1920;
1964正式成為上海第二醫科大學附屬第九人民醫院(以下簡稱“九院”)。2005年,上海第二醫科大學和上海交通大學正式合並,九院更名為上海交通大學醫學院附屬第九人民醫院(以下簡稱“九院”)。
20111 2004年,經上海市人民政府同意,上海交通大學醫學院附屬第九人民醫院和上海交通大學醫學院附屬第三人民醫院(原三級綜合醫院寶鋼醫院)進行資源整合,南北校區統壹布局管理。