1，上課方式不同。
在職博士可以邊工作邊學習，上課方式主要是周末班和強化班，主要利用周六周日時間、節假日、寒暑假等。，而且上課的方式也比較自由。而全日制博士主要是在校學習，必須是全日制，上課方式單壹。
2.應用方法不同。
報考在職博士有兩種方式。壹個是只能拿到博士學位，壹個是可以拿到博士學位和博士學位的雙證。但是只有壹個辦法，申請全日制博士，可以拿到博士學位和學位證。
3.適用條件不同。
在職醫師註冊條件
1，申請人取得碩士學位後工作五年以上；
2.申請人應在教學、科研和專業技術領域取得突出成績，在申請學位領域獨立發表高水平學術論文或出版高水平專著，其科研成果獲得國家級或省級以上獎勵。
全日制博士研究生條件
1.申請人必須是取得碩士學位的人員、應屆碩士畢業生(最遲須在入學前取得碩士學位)或取得學士學位6年以上並達到與碩士畢業生同等學力的人員；
2.申請人應在教學、科研和專業技術領域取得突出成績，在申請學位領域獨立發表高水平學術論文或出版高水平專著，其科研成果獲得國家級或省級以上獎勵；
3.具備申請博士學位基本條件的同等學力人員。