地理信息系統作為信息集成、處理和分析的平臺，在航海學科和應用中發揮了重要作用。地理信息系統(GIS)已成為電子海圖、交通信息化、船舶模擬、安全與救援等重大科研和應用項目的核心支撐技術。2007年，根據行業發展要求，交通部正式批準設立GIS專業。
本專業學制四年，招收思想政治素質好，組織紀律性強，熱愛交通、航海與信息技術，學習英語的男生。GIS的主要專業基礎課和專業課有:GIS、遙感原理與應用、GPS原理與應用、測量學、電子海圖系統、航海、航海氣象與海洋學、海事管理、GIS二次開發、遙感圖像處理與分析、空間分析、數據庫原理與應用、VTS與AIS原理與應用、GIS與遙感實務。
本專業合格畢業生應能在科研機構或高等院校從事科學研究或教育工作，並能從事與地理信息系統相關的應用研究、技術開發、行政管理等實際工作。在交通、航海、港口管理、海事管理、物流、測繪、海洋和環境監測、規劃管理等領域。