1.大氣科學:南京信息工程大學的大氣科學專業是中國最好的，也是世界知名的。該專業在世界範圍內具有較高的知名度和影響力，是我國氣象事業的重要人才培養基地。
2.計算機科學與技術:該專業在全國排名靠前，擁有壹支高水平的教研團隊和壹批研究所、實驗室，為學生提供了良好的實踐和研究環境。
3.信息與通信工程:該專業在國內也排名靠前，擁有壹流的教學設施和實驗設備，培養了大批優秀畢業生。
4.環境科學與工程:該專業在國內具有壹定的影響力，擁有壹支高水平的教研團隊和壹批科研院所和實驗室，為學生提供了良好的實踐和研究環境。
5.應用氣象學:該專業是南京信息工程大學的特色專業之壹，培養了大批優秀畢業生，為我國氣象事業做出了重要貢獻。
6.地理信息科學:該專業在全國具有壹定的影響力，擁有壹支高水平的教學科研隊伍和壹批研究所、實驗室，為學生提供了良好的實踐和研究環境。
7.軟件工程:該專業在國內具有壹定影響力，擁有壹流的教學設施和實驗設備，培養了大批優秀畢業生。
這些專業是南京信息工程大學的優勢專業，教學質量高，就業率高，是學生選擇的好專業。