生產的出口產品可憑報關單等相關單證向稅務機關申請出口免抵退稅。為履行產品出口合同，在投資總額內進口自用設備及其配件，或者進口直接用於加工出口產品的合理數量的輔料，免征進口關稅、進口環節增值稅和消費稅。購買國產設備免征增值稅。經營期在十年以上的生產性企業，從開始獲利的年度起，享受“兩免三減”的稅收優惠。對生產性企業，根據行業性質和投資額大小，減按24%或15%的稅率征收企業所得稅。按照國家規定減免企業所得稅期滿後，當年出口產品產值達到當年產品產值70%以上的，可減半征收企業所得稅(不低於10%)。先進技術企業享受國家規定的企業所得稅減免優惠期後，延長三年，減半(不低於10%)征收企業所得稅。外國企業向中國轉讓技術，可申請免征營業稅或企業所得稅。技術開發費用比上年增長10%以上的，允許按技術開發費用實際發生額的50%在當年應納稅所得額中扣除。以企業利潤再投資，經營期不少於5年的，全額退還或退還再投資部分已繳納企業所得稅的40%。蓬萊經濟開發區不僅可以享受上述國家規定的稅收政策，還可以根據企業投資情況返還部分地方稅收。
蓬萊經濟開發區根據投資經營情況，給予入區企業優惠待遇，獎勵地方稅收收入，入區企業應享受上述國家規定的稅收政策。