1，性質不同
(1)深圳清華大學研究院是科研機構，企業化事業單位，實行理事會領導下的院長負責制。
(2)清華大學深圳國際研究生院是壹所高等學校，是清華大學與深圳市合作設立的公立研究生教育機構。
2、成立時間不同。
(1)深圳清華大學研究院成立於1996；
(2)清華大學深圳國際研究生院成立於2001。
3.不同的地理位置
(1)深圳清華大學研究院位於深圳市高新技術產業園區南區深圳清華大學研究院A402室；
(2)清華大學深圳國際研究生院位於深圳市南山區西麗大學城清華校區。
4.不同的發展目標
(1)深圳清華大學研究院
致力於金融助力科技成果轉化，依托科技特色金融體系創新，全面打造輻射國內外的科技創新孵化體系和產業投資平臺，培育關系國民經濟命脈、行業領先、具有長期可持續性的戰略性新興產業。
(2)清華大學深圳國際研究生院。
致力於建設世界壹流的研究生院，成為服務社會、引領發展的壹流人才培養基地，跨學科融合的國際創新研究中心，產學研合作辦學和國際化的典範。
深圳清華大學研究院-研究院簡介。
？清華大學深圳國際研究生院概述