第壹，培養目標不同。
MBA，即工商管理碩士，旨在培養能夠勝任企業、國家單位和經濟管理部門的高級管理人才，主要是培養企業的高級管理人員。
MPAcc即會計碩士，旨在培養能夠解決企業日常工作問題，掌握現代會計理論、財務知識、審計知識的高素質、高專業技能的高級財務人才。
第二，應用需求不同。
MBA要求申請人具有國家承認的本科或專科畢業證書，本科畢業後有三年及以上工作經驗，專科畢業後有五年及以上工作經驗。MPAcc要求本科畢業生，或有兩年或兩年以上工作經驗的大學畢業生申請。
第三，MBA和MPAcc最大的區別是兩個專業的學費不同。MBA的學費比MPAcc的學費要高。
比如說；北大MBA全日制218000，非全日制328000，東北財經大學全日制62000，非全日制88000，MPAcc北大全日制158000，東北財經大學全日制35000，非全日制80000。
參考資料:
百度百科-MBA
百度百科-MPACC