南京醫保支付三個月後才能使用，主要是為了保證醫保基金的平穩運行和醫保服務的質量和效率。這也是為了保證個人身體狀況的真實性和醫療服務的合理性。
繳費後三個月內，需要使用醫保服務，自費支付醫療費用。繳費三個月後，可以享受醫保報銷待遇。