1，發行人差異
股票發行人是上市公司；債券的發行人可以是公司、政府和金融機構；基金的發行人是基金管理人公司。
2.風險和預期收益的差異。
股票的預期收益和風險取決於上市公司的經營狀況，風險和預期收益最高。基金是壹種集合資金，分散投資的方式，在壹定程度上分散了風險，其次是預期收益和風險。債券是投資者借錢給債務人，債務人到期按壹定比例還本付息的那種，所以其風險和預期收益是最低的。
3.體現關系的不同。
股票反映了所有權關系。投資者通過購買股份成為發行公司的所有者，按持股比例獲得預期的經營收益，並參與重大決策投票。資金體現的是信托關系，債券體現的是債權債務關系。
4、資金投入的差異。
上市公司通過股票募集的資金主要投資於實業，這是壹種直接投資方式，而基金公司通過發行基金募集的資金主要投資於股票、債券等證券，這是壹種間接投資方式；發行債券的公司、政府和金融機構為追加資金而借款，籌集的資金作為公司業務發展的自有資本，也是壹種直接投資。