1、具備基礎研究經歷：申請人需要有從事基礎研究的經歷。
2、專業技術與學位要求：申請人需要具有高級專業技術職務（職稱）或博士學位，或者具備兩名與其研究領域相同、且具有高級專業技術職務（職稱）的科學技術人員的推薦。
3、研究生身份限制：正在攻讀研究生學位的人員不得申請，但在職攻讀研究生學位人員經過導師同意可通過其受聘單位申請。
4、申請間隔要求：如果申請人在過去的2年（例如2021和2022年度）連續申請面上項目但未獲資助（包括初審不予受理的項目），則不得再次作為申請人申請。
5、年齡限制：對於青年科學基金，申報當年1月1日男性未滿35周歲，女性未滿40周歲，且未曾獲得過該類項目資助。
6、變更依托單位：自2023年7月4日起，取消面上項目、青年科學基金項目、地區科學基金項目不允許博士後變更依托單位的限制。對於經審核符合相關規定、且變更後單位可以支撐保障其正常開展研究工作的，允許其變更依托單位。
7、港澳地區開放：自2024年起，國家傑出青年科學基金項目向港澳地區依托單位開放，優秀青年科學基金項目（港澳）並入優秀青年科學基金項目，港澳和內地的申請條件、評審流程保持壹致，同臺競爭，擇優資助。