持倉份額小於本金有以下原因:
1，產品單位凈值高於1。
以基金為例，基金持倉份額根據基金凈值計算，認購份額=[認購金額/(1+認購費率)]/T日基金凈值。在不考慮申購費等費用影響的情況下，只有當基金份額凈值等於1時，份額才等於本金；當基金單位凈值小於1時，份額大於本金；當基金單位凈值大於1時，份額小於本金。比如基金本金10000元，基金凈值1.25，持倉份額8000，小於本金。
2.在投資交易中，將需要手續費、傭金或其他交易成本，因此頭寸份額是通過扣除手續費來計算的，手續費將少於本金。
以基金為例。根據收費方式的不同，同壹基金產品可分為A類和C類，其中A類基金的認購費用直接從認購金額中扣除，可能導致持有份額低於本金。例如，投資者購買1，000元的基金產品，價格低於1.5%的基金申購費率通常為1，申購當日基金份額凈值為1，則申購份額=(10000-10000 * 1。
另外，基金賣出需要贖回，基金賣出費用等於基金賣出總額*贖回費率。例如，交易日基金凈值為1，賣出費率為10000元，贖回費率為1.35%，賣出費用為135元。因此，在贖回理財產品時，實際收到的金額會與申請贖回的份額有所不同。