專項審計報告是指註冊會計師根據中國註冊會計師審計準則的規定，在實施審計工作的基礎上，對被審計單位專項項目資金財務報表發表審計意見的書面文件。
專項審計報告應包括以下主要內容:
壹.解釋
1.說明委托方名稱(被審計企業名稱)和委托目的(審計目的)；
2.解釋會計責任、審計責任和審計依據。
2.企業和項目基本信息
1.企業基本情況，包括:公司名稱、註冊日期、營業執照簽發機構、註冊號、註冊資本、法定代表人、公司住所、經營範圍。
2.簡要描述項目。
三。基金項目合同及相關規定
1.項目申請時間、項目名稱、合同簽訂時間、項目立項代碼、獲得創新基金的金額和方式。
2.項目總投資。
3.創新資金用途。
4.項目合同中規定的經濟指標。
四。合同執行期間項目各項經濟指標的完成情況
1.資金的可獲得性
2.資本支出
3.項目各項經濟指標完成情況
(1)項目銷售收入(按年度)
(2)工程造價
(3)項目納稅情況
(4)項目應承擔的期間費用。
(5)項目實現盈利。
動詞 （verb的縮寫）報告的註釋
1，會計政策註釋。
2.適用於企業的稅種和稅率。
3.主要財務指標註釋。