經濟學獎被質疑的常見論據是，經濟學有廣泛的倫理基礎，和數學壹樣嚴謹。
經濟學獎的頒發，也常被質疑違背了諾貝爾遺囑中“對全人類做出巨大貢獻”的要求。因為，經濟學家的貢獻不見得名實相符，而獲獎最多的新古典主義學派，也不存在“處理金融災難的知識系統”。 雖然經濟學獎在1969年設立之後，成功整合進入了諾貝爾獎的評選體系裏，但爭議輩出。包括弗裏德裏希·哈耶克（1974年得主）在內的四名獲獎人，皆曾經呼籲廢除此獎。哈耶克領獎時表示，倘若當年征詢他的意見，肯定不建議設獎。
1997年，諾貝爾文學獎的評選機構呼籲瑞典皇家科學院廢除經濟學獎。
根據諾貝爾基金會在2009年的官方立場，經濟學獎並不是諾貝爾獎。但此壹聲明旋遭移除。諾貝爾後人對於瑞典國家銀行的作法，也多所批評，認為這是經濟學者企圖提升地位和聲譽的手段，其侄孫Peter Nobel更稱有關獎項是占諾貝爾之名的布谷鳥。