醫療基金是指未納入公費醫療範圍，參照公費醫療制度有關規定，從收入中按當地財政部門規定的公費醫療標準提取，用於職工公費醫療的資金。
比如壹個事業單位不納入公費醫療範圍，從事專業業務及其輔助活動的有300人，從事生產經營活動的有100人。醫療基金按當地財政部門確定的年人均公費醫療預算定額標準從200元中提取。