1.指數跟蹤的對象是不同的。科創板50ETF跟蹤上證科創板50指數，科創50ETF跟蹤上證科創板50指數。
2.它們在基本概念上略有不同。科創板50ETF指的是科創板50指數，科創50ETF指的是科創板50 ETF。
3.發行規模也有差異。科創板50ETF擬募集不超過300億元，科創50ETF擬募集不超過20億元。
4.運作方式也有區別。科創板50ETF實行全場交易，即全天在交易所開放時間內繼續交易；科創50ETF屬於場內交易品種，只能在交易所上市期間交易。