唇腭裂免費基金需要先自己去申請，滿足條件通過申請之後，會接到相應基金會的通知，然後到指定醫院進行治療。唇腭裂慈善機構有很多，比較知名的有美國微笑列車基金、中國微笑行動、嫣然天使基金、李嘉誠重生行動等等。
下面以微笑列車基金舉例來說明：
救助範圍：患者年齡3個月至40周歲的貧困唇腭裂患者。
矯治範圍：唇裂，腭裂，唇腭裂，包括唇、腭隱裂以及需要二次修復的唇腭裂患者。
患者申請免費手術的程序：凡年齡在3個月至40周歲的貧困患者，均可持當地鄉（鎮）以上政府部門出具的貧困證明，到所在省慈善、（民政）部門或當地“微笑列車”定點醫院登記預約手術。