優秀青年科學基金項目評審程序包括同行專家通訊評審和會議評審。
(1)通訊評審:由5名以上同行專家進行評審,每份申請的有效評審意見不少於5份。
(2)會議評審:會議評審專家為9人以上,參加會議評審的項目申請人應當到會答辯。會議評審專家以無記名投票的方式表決,贊成票過半數的為建議資助項目。 優秀青年科學基金項目由自然科學基金委委務會議審議批準。