森林退化也會對水資源產生影響，並導致幹旱。巴西大部分雨水來自亞馬遜雨林，蓄水能力為巴西及周邊國家的河流提供水資源。當樹木遭遇幹旱時，枝葉枯萎，雨林的樹冠變得稀疏，更加不利於保濕，幹旱成為林火的助燃器。
環境保護主義者說亞馬遜雨林是不尋常的，因為它可以回收大部分自己的水。隨著雨林面積的迅速縮小，其循環利用功能正在減弱。在壹定的閾值下，這種萎縮會進壹步加速。悲觀者擔心，如果雨林面積進壹步減少3%-8%，亞馬遜雨林可能會進入不受控制的退化周期。
今年7月，國際環境組織綠色和平組織(Greenpeace)表示，博爾索納羅及其政府對氣候平衡構成了威脅。該組織還警告稱，從長遠來看，博爾索納羅的政策將給巴西經濟帶來“沈重的代價”。
環保組織“世界自然基金會”警告稱，如果亞馬遜雨林的環境破壞達到不可逆轉的程度，雨林可能會變成幹燥的稀樹草原，不再適合其大部分野生動物的生存。屆時，這種“氧氣來源”將轉向碳排放，從而導致全球氣候變化向不可逆轉的方向發展。