南京醫科大學是國家“雙壹流”建設大學。首批醫學院校由教育部、國家衛生健康委員會、江蘇省人民政府共建，江蘇省高水平大學建設峰會計劃A類建設大學。
學校創建於1934，當時命名為江蘇省醫藥管理高等專科學校。抗戰時期，更名為國立江蘇醫學院。1957年由鎮江遷至南京，更名為南京醫學院。1962，被列為全國首批六年制醫學院校。1981年獲批全國首批博士、碩士學位授予單位。1993，更名為南京醫科大學。
學科建設:
目前有壹級學科博士學位授權點8個，兩個學科博士學位授權點54個，交叉學科博士學位授權點5個，專業博士學位授權點2個。壹級學科11個碩士學位授權點，二級學科65個碩士學位授權點；博士後科研流動站6個，學位授權點覆蓋醫、理、工、管、法、教、文7個學科。
國家重點學科3個，1國家重點(培育)學科，國家臨床重點專科29個，江蘇高校優勢學科6個(三期)。
南京醫科大學是教育部、國家衛生計生委、江蘇省和江蘇省高水平大學首批共建高校。是江蘇省高層次人才培養計劃“333工程”培訓基地，長三角醫學教育聯盟創始成員。
擴展數據
南京醫科大學的社會評價；
2020年7月，南京醫科大學在“2020年中國百強大學”綜合榜單中排名第89位，在“2020年中國百強大學”進展榜單中排名第35位。
2019年學校獲得291國家自然科學基金項目支持，項目數連續六年在獨立醫科大學排名1。連續多年被評為“江蘇省科技先進高校”。