計入營業稅金及附加科目，具體如下：
計提時
借：營業稅金及附加
貸：應交稅費--應交水利建設基金
繳納時
借：應交稅費--應交水利建設基金
貸：銀行存款
按照現行的會計準則，是計入"營業稅金及附加"科目，原"主營業務稅金及附加"科目取消了。
擴展資料：
水利建設基金的征收標準
水利建設基金是專項用於水利建設的政府性基金。水利建設基金應按照銷售收入來計提和交納。各省市的征收比例各不相同。
2018年7月1日起，國家重大水利工程建設基金征收標準再統壹降低25% 。
北京於2019年起停征地方水利建設基金，預計給單位和個人減負2億元。?
免繳範圍
1、未達到增值稅起征點的生產經營單位和個體工商戶；
2、國家規定免征增值稅的生產經營收入；
3、駐湘軍工企業（不含已核發了工商營業執照的軍轉民企業）銷售軍工產品收入；
4、國防工程、防洪工程（不含經營服務性配套設施建設）、孤兒院、敬老院建設用地；
5、國家規定的其他免征情形。
百度百科--新會計準則
百度百科 --應交稅費