流動性低，大部分基金類型流動性低，贖回慢，需要3-5個工作日。
交易費用高，大部分基金需要申購費和贖回費。如果短時間持有，進出口費高達1.1%，仍是降低後的費率。當然，很多基金公司在直銷渠道大幅降低了費率，但在代理渠道很難降低。
其他費用也不低，比如管理費、托管費、銷售服務費等。這三種費用每天都要收。當然，作為約定的代理投資，這些費用是不可避免的。
公募基金缺乏良好的激勵機制，基金經理很容易跳槽。
公募基金中的基金壹般規模較大，難以操作。
公募基金的投資方向還是相對固定的。
作為壹種大眾金融產品，公募基金總體上利大於弊，很多不足正在被糾正。在成本和投資方向的擴展方面，它進展緩慢。