黃山在其峰林結構形成之前,經歷了造山運動和地殼隆升,以及冰川和自然風化。黃山共有72座山峰,素有“三十六峰,三十六小峰”之稱。主峰蓮花峰海拔高達1864.8米,與光明頂、天都峰並稱黃山三大主峰,為36大主峰之壹。
黃山以燕山期花崗巖為主,垂直節理發育,侵蝕切割強烈,裂隙交錯,長期水蝕,形成花崗巖洞穴和通道。整座山有30個山脊,22個巖石,7個洞穴和2個通道。黃山第四紀冰川遺跡主要分布在千山東南部。