辦理留學手續主要分為三個階段：
1、獲得留學學校的入學許可；
2、通過學校等機構向日本法務省入境管理局申請、取得“在留資格認定證明書”；學校取得“在留資格認定證明書”後，將原件郵寄給學生。?
3、申請並取得簽證，憑“在留資格認定證明書”申請在留資格為“留學”的簽證。
從日本院校獲得入學許可後，需要申請赴日簽證以及在日居留資格證明。居留資格根據外國人在日本可以進行的活動、身份或地位分成30類。在日本學習所需的居留資格為“留學”。若持留學以外的居留資格，能申請的獎學金和適用的入學考試方式有限。
通過學校等機構向日本法務省的各地入境管理局申請“在留資格認定證明書”。獲得了“在留資格認定證明書”後，通過簽證代辦機構向日本國駐華大使館領事部或各地的總領事館申請簽證。
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