企業為職工代扣代繳的個人所得稅部分應計入管理費用會計科目。管理費用包括：
1、公司經費總部管理人員工資、職工福利費、差旅費、辦公費、董事會會費、折舊費、修理費、物料消耗、低值易耗品攤銷及其他公司經費；
2、勞動保險費指離退休職工的退休金、價格補貼、醫藥費（包括離退休人員參加醫療保險基金）、異地安家費、職工退職金、職工死亡喪葬補助費、撫恤費、按規定支付給離休幹部的各項經費以及實行社會統籌基金；待業保險費指企業按照國家規定繳納的待業保險基金；
3、董事會會費是指企業最高權力機構及其成員為執行職能而發生的各項費用，包括差旅費、會議費等。
4、其它費用企業發生與生產、經營直接有關的業務招待費，納稅人能提供真實有效憑證或資料，在下列限度內準予作為費用列支.因此企業為職工代扣代繳的個人所得稅部分應計入管理費用會計科目。