自1985年來，學校相繼和美國哈佛大學醫學院、澳大利亞西澳大學醫學院，美國加州大學舊金山分校醫學院、香港中文大學醫學院、香港大學醫學院、澳門鏡湖護理學院簽訂了校際交流的協議，互相交換高年級學生到對方學校進行短期臨床學習。
自1993年起學校獲準招收外國自費留學生，1997年起又獲準招收該國臺灣、香港、澳門地區學生，先後有美國、加拿大、新西蘭、馬來西亞、印度尼西亞、英國和臺灣、澳門地區的學生來校學習。
經國家衛生部和教育部批準，協和醫大在美國中華醫學基金會（紐約）的資助下，自1995年起還設立了該國首個醫學博士和理學博士（M.D. & Ph.D.）雙學位教育項目，實現了與國際高層次醫學教育的接軌。
該項目選拔少數經過八年學習、取得醫學博士（M.D.）學位的優秀畢業生，繼續學習3年時間，進壹步加強其科學研究能力的訓練。